降低海外仓建设中的税务合规风险，企业需要采取一系列策略和措施，确保在国际税收框架下运作顺畅：

1. 了解并遵守当地税法：

   - 深入研究目标市场国家的税法，包括增值税（VAT）、关税、销售税等，确保业务活动符合当地规定。

   - 在欧盟等地区，了解并执行增值税注册和申报要求，避免因未正确注册而产生的罚款。

2. 利用税收协定：

   - 利用中国与目的国之间的双边税收协定，避免双重征税。通过税收抵免或特定条款，优化税务结构。

3. 转让定价策略：

   - 确保与海外关联公司之间的交易价格符合国际转让定价原则，避免税务机关的审查和调整风险。

   - 准备详细的转让定价文档，证明交易价格的公平性和合理性。

4. 出口退税合规操作：

   - 根据《跨境电商出口海外仓出口退（免）税操作指引》，正确处理出口退税流程，区分销售给境外公司与备货海外仓的不同处理方式。

5. 税务规划与咨询：

   - 雇佣专业税务顾问，进行税务规划，确保所有操作合法且最大化税务效益。

   - 定期咨询以应对税法变动，保持合规性。

6. 建立合规体系：

   - 建立健全的税务合规管理体系，包括内部培训，确保所有员工了解相关税务规定。

   - 实施定期的税务审查和自我评估，及时发现并纠正潜在的不合规问题。

7. 透明记录与报告：

   - 保持清晰、准确的财务记录，确保所有交易都有据可查，便于税务审计。

   - 定期向相关税务机关报告，包括跨境交易的详细信息。

8. 外汇管理合规：

   - 确保所有外汇交易符合两国的外汇管理规定，及时收汇、结汇，并与出口报关数据保持一致。

9. 风险管理与应对策略：

   - 制定应对税务调查的预案，包括法律支持和危机管理计划。

通过上述措施，企业可以有效降低海外仓建设与运营中的税务合规风险，确保业务的稳定发展。