爱沙尼亚的港口主要包括以下几个：
1. 塔林港 (Port of Tallinn, EETAL) ：
- 位于爱沙尼亚北部沿海芬兰湾口南岸，濒临波罗的海的东北侧。
- 是爱沙尼亚的首都和最大港口，也是波罗的海各港口中吞吐量排名第二的港口，仅次于拉脱维亚的文茨皮尔斯。
2. 穆格港 (Port of Muuga, EEMUG) ：
- 穆格港是爱沙尼亚的一个重要港口，位于塔林东部。
3. 纳尔瓦约埃苏港 (Port of Narva-Jõesuu, EENAJ) ：
- 位于爱沙尼亚东北部，是一个重要的地区港口。
4. 派尔努港 (Port of Pärnu, EEPAR) ：
- 位于爱沙尼亚西部，是一个重要的地区港口。
爱沙尼亚的港口在波罗的海地区具有重要的战略地位，塔林港尤其重要，不仅是国家的商业和工业中心，还是科技文化中心。爱沙尼亚港口的货物吞吐量在逐年提升，特别是集装箱吞吐量增长迅速。政府也在港口发展计划中投入资金，以提升港口的基础设施和吞吐能力。